Entdeckt wurde Reiki durch Dr. Mikao Usui (15.8.1865 - 9.3.1926). Nachfolgend die Geschichte, die am weitesten verbreitet ist (was nicht bedeutet, dass sie wahr sein muss). Angeblich war er der Sohn einer reichen japanischen Familie den es nach wissen dürstete. Er zog jahrelang studierend durch Asien bis er sich einem buddhistischen Kloster zuwandte und Mönch wurde. In 21-tägiger Askese auf dem heiligen Berg Kurama erhielt er nach Fasten und Meditationen die göttliche Einstimmung in Reiki. Auf dem Weg nach unten stieß er sich den Zeh blutig, legte die Hand auf und stillte damit Blutung und Schmerz.

Faktisch belegt ist die Tatsache dass er nach seinem Erlebnis 1922 in Tokio das noch heute existierende "Usui Reiki Ryoho Gakkai" (Gesellschaft für das Heilen durch Usui-Reiki) gründete und eine Reiki Klinik mit Vorlesungen und Behandlungen eröffnete. Während seiner Arbeit mit Reiki entwickelte er die 6 Reikigrade, von denen 6-3 heute den ersten Grad ausmachen, der Zweite den Zweiten und der Erste den Dritten. Außerdem stellte er nach buddhistischen Vorbild 5 Lebensregeln auf. Er bereiste Japan um Reiki unter die Menschen zu bringen, er wollte es allen zugänglich machen und auf der ganzen Welt verbreiten.

Er starb an einem Schlaganfall während einer Vorlesung in seiner Klinik.

Nach Usuis Tod löste sich ein Meisterschüler vom Gakkai und gründete seine eigene Gesellschaft. Er entwickelte sogar eine eigene Art von Reiki. Sein Name war Dr. Hayashi. Auf dieses "Hayashi-Reiki" und eine Amerikanerin namens Hawato Takata gründet sich unser heutiges westliches Reiki.

Frau Takata lebte auf Hawaii bis eine schwere Krankheit und die Sehnsucht nach ihren Eltern sie Heilung in Japan suchen lies. Sie lernte Dr. Hayashi kennen, der sie mit Reiki in wenigen Monaten heilte. Sie blieb in Japan, erlernte in Hayashis Schule die Grade 1 und 2 und kehrte dann nach Hawaii zurück. Dr. Hayashi folgte ihr, gemeinsam bereisten sie Hawaii und gaben Behandlungen, lehrten Reiki und hielten Vorträge. 1938 erhielt Frau Takata den 3. Grad und eröffnete zwei Schulen auf Hawaii. Bis zu ihrem Tod 1980 weihte sie 22 Meister ein, eine Liste mit deren Namen gab sie vor ihrem Tode ihrer Schwester.